中央空调停运后，冷却水系统和冷冻水系统的清洗可用采取单台设备清洗方式或全系统清洗方式。但无论是单台设备清洗还是全系统清洗，一般都使用清洗槽和清洗泵将单台设务或原系统(可使用原系统的水泵)构成一个闭合回路进行循环清洗。
清洗一般按下列程序进行。灭藻清洗、碱洗、封存、(中)钝化、碱洗后水冲洗、运行、(中和)预膜、酸洗、漂洗、酸洗后水冲洗、水冲洗(检漏)
尽量每月开次机：
注意经常检查空调器电源插头与插座是否接触良好、无松动或脱落，通风道是否阻塞，空调运行时声响是否正常。在不使用空调的季节，也要保持一个月开机一次的使用量。空调的工作核心是压缩机，如果长时间不使用，压缩机内润滑油可能会凝结，影响下一次的使用。
使用季结束后清洗：
中央空调应对季节性停机时，建议做好清洗工作。清洗中央空调过滤网时，将过滤网抽出来，用吸尘器把上面的尘土吸干净，也可以用清水冲洗干净。晾干后装入空调使用。对尘土较多的环境，过滤网应该经常清洗，以免灰尘太多堵死出风口，而影响制冷效果。清洗好后只开空调器的风机，运转约2至3小时，使空调器内部干燥，祛除湿气。
环境温度过高：压缩机应用相关手册中给出的要求是环境温度不超过40℃，因此在予以应用的时候就需要首先确认环境温度是否符合这样一个要求。一旦环境温度过高，就立即停机，以此来避免更大的损失发生；除此之外，还需要检查工作环境的通风状况以及冷却状况是否良好。通过这样一系列的检查、处理和保障，基本上就能够保障压缩机工作环境的温度符合要求。
轴承的损坏：如果振动感应器所感应到的振动是发生在轴承的附近，则可能的原因就是供油不足或者是存在着杂质，这样一些情况都有可能导致轴承磨损和振动的发生，这样一种情况发生以后就需要尽快的更换轴承。